学校根据中央、省委、省政府及各部门关于科研项目、科研经费的文件要求，结合学校科研工作实际，创新科研机制，激发科研活力，充分调动教师参与科研工作的主动性和积极性。
学校获批农业部彬州国家农业科技创新与集成示范基地、获批省科技厅陕西省动物疫病防控工程技术研究中心和陕西省草莓工程技术研究中心，目前为陕西高职唯一获批学校。获批科技厅杨凌职业技术学院彬州市农业科技创新试验示范站和凤县林麝产业科技创新示范站。获批省教育厅动物疫病防控陕西省高校工程研究中心和反刍动物高效繁育技术陕西高等学校重点实验室。
获批陕西省教育厅高校青年创新团队3个，杨凌示范区青年育种专家6人。学校建立2院（蜂产业研究院、陕西职业教育乡村振兴研究院）、2个院士工作室（康振生院士农业生物工程工作室、张涌院士动物遗传育种应用工程中心）、北方草莓产业研发中心等“2院2室7中心”、省内外28个产学研示范基地、34个“博士+高职生”、11个“专家教授+科研成果+推广基地”为支撑的校内科创平台。区校共建7个校外科创平台，推动高水平科技研发创新平台建设。建立校级技术技能创新服务平台，激发工作室等农业职业教育“农科教、产学研”示范推广模式活力，形成“区校、校企、产教”二元三融一体化科创新形态，提升科技创新服务水平。